hmm_appl(1).pdf

(3266 KB) Pobierz
Statystyczna analiza
danych
ukryte modele Markowa,
zastosowania
Anna Gambin
Instytut Informatyki
Uniwersytet Warszawski
Thursday, March 20, 14
plan na dziś
Ukryte modele Markowa w praktyce
•
multiuliniowienia
•
•
Thursday, March 20, 14
modelowania rodzin białek
znajdowanie genów
model rodziny białek
Cele:
•
•
dla danej sekwencji identyfikacja
zbudowanie multiuliniowienia
rodziny
Thursday, March 20, 14
model rodziny białek
d1
i0
i1
d2
i2
d3
i3
d4
i4
m0
m1
m2
m3
m4
m5
profilowy HMM
Thursday, March 20, 14
model rodziny białek
•
długość sekwencji w przykładzie - 5
•
stany: match, insert, delete
•
m0 - stan początkowy, m5 - końcowy
•
alfabet - 20 aminokwasów plus dziura
Thursday, March 20, 14

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika:

Zgłoś jeśli naruszono regulamin