bioinformatorek_no_12(4).pdf

(2294 KB) Pobierz
bioinformatorek
#12 (2015)
Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego
Polish_BioInformatics_Society_News
http://ptbi.org.pl/
red. nacz. Wiesław Nowak IF UMK,
zespół: Aleksandra Gruca PŚl,
Małgorzata Kotulska, PWr,
Marta Szachniuk, PP
Koleżanki i Koledzy,
W tym roku mieliśmy okazję gościć w Warszawie prestiżową
konferencję z biologii obliczeniowej - RECOMB. Wśród
zaproszonych wykładowców był m.in. laureat nagrody Nobla
Michael Levitt, wśród prowadzących sesję m.in. Michael
Waterman – od którego sławnego algorytmu dla bardzo wielu z
nas zaczęła się przygoda z bioinformatyką. Nasze Towarzystwo
było współorganizatorem konferencji, sponosorowaliśmy z
naszych środków udział 5 osób, dla kolejnych 20 osób
pomogliśmy znaleźć finansowanie u sponsorów.
Za nami również bardzo udana, choć w tym roku
dość kameralna, konferencja BIT. Relacje z obu konferencji
zajmują większość dzisiejszego numeru Bioinformatorka.
Poza tym dużo zdjęć, bioinformatyka na śpiewająco, informacja
o czekającym nas we wrześniu Sympozjum PTBI połączonym z
Walnym Zebraniem Towarzystwa, użyteczne linki, doniesienia
medialne o bioinformatyce oraz
last but not least
– ogłoszenie
wyników konkursu na najlepszą pracę magisterską obronioną w
2014 roku.
Zapraszam do lektury
Witold Rudnicki
Prezes PTBI
Zarząd:
Witold Rudnicki (prezes)
Wiesław Nowak (wiceprezes)
Marta Szachniuk (wiceprezes)
Aleksandra Gruca (skarbnik)
Małgorzata Kotulska (sekretarz)
Komisja Rewizyjna:
Anna Gambin (przewodnicząca)
Piotr Łukasiak
Andrzej Polański
Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne
Adres do korespondencji:
Dr hab. Witold Rudnicki (PTBI)
ICM, Uniwersytet Warszawski
ul. Prosta 69, piętro 2
00-838 Warszawa
REGON 141348225
NIP 7010118646
Nr Konta 85 1240 1053 1111 0010 1724 1817
Składki członkowskie za rok 2015 wynoszą: 80 zł,
studenci i doktoranci – 40 zł
W dniu 22.05.2015 liczba członków wynosiła
180.
Informacje o zjazdach i konferencjach
Nasze coroczne Sympozjum PTBI połączone z Walnym Zebraniem odbędzie
się w tym roku w Lublinie – kolejne miejsce na bioinformatycznej mapie
Polski. Konferencja będzie organizowana wspólnie z Polskim Towarzystwem
Chemii Medycznej i odbędzie się w dniach 17-19 września na kampusie
Uniwersytetu Medycznego. Tym razem format konferencji będzie dużo
bardziej zbliżony do naszego zwykłego schematu – jeden dzień będzie
wspólny z chemikami, drugi będzie podzielony na dwie równoległe sesje.
Mamy nadzieję, że będzie to dobra okazja to nawiązania interesujących
kontaktów naukowych!
Adres WWW:
http://ptbi.org.pl/zjazd2015/
Uwaga: Abstrakty należy nadsyłać do 7 czerwca 2015 ! !!
Rys. wiki
2
Konferencja RECOMB 2015 w Wwie
W dniach 12-15 kwietnia 2015 Hotel Sofitel Victoria
w Warszawie gościł
RECOMB 2015
-
19th Annual
International
Conference
on
Research
in
Computational Molecular Biology.
RECOMB ma celu
łączyć metody obliczeniowe, matematyczne i
statystyczne z naukami biologicznymi. Wśród
organizatorów konferencji prym wiedli prof. Jerzy
Tiuryn i dr Bartek Wilczyński z Uniwersytetu
Warszawskiego. RECOMB poprzedziły 2 satelitarne
warsztaty: RECOMB-SEQ
(Massively Parallel
Sequencing ) i RECOMB-CCB (Computational
Cancer Biology). Główną konferencję w niedzielny
poranek rozpoczął „mocnym uderzeniem” wykład
prof. Michaela Levitta ze Stanford University -
laureata pierwszej nagrody Nobla przyznanej za
metody bioinformatyczne -
Birth and future of
multiscale modeling of macromolecules.
Wykład
poprzedziło wprowadzenie Michaela Watermana –
również bardzo znanej postaci w świecie
bioinformatyków.
(n.b.
Prof. M.Waterman, wspólnie
z Dr C.Clothią i prof. D.Hausslerem jest laureatem
tegorocznej nagrody Dan David Prize w kategorii
Future za „Biomechanics” (1 mln $) .
Na zdjęciach – Laureat Nagrody Nobla Michael Levitt;
Poniżej Michael Waterman (fot. Paweł Górecki)
3
RECOMB 2015 (2)
Po wykładzie nastąpiły sesje tematyczne, których było 14 i obejmowały różne aspekty analizy sekwencji i
drzew filogenetycznych, genów, a także modelowania struktur molekularnych i sieci oddziaływań.
Fot. Paweł Górecki
Poszczególne dni otwierały wystąpienia zaproszone. Usłyszeliśmy wykłady
Bonnie Berger
Computational
biology in the 21st century: Algorithms that scale,
M. Madana Babu
The contribution of intrinsically disordered
regions to protein function, cellular complexity and human diseases,
Bas van Steensel
Mapping genome –
nuclear lamina interactions in single cells
i
Magdaleny Konarskiej
Analysis of spliceosome function: from the
mechanisms of catalysis to interconnections within global networks of gene expression
Szczególnym zainteresowaniem cieszył się wykład specjalny (im. Stanisława Ulama) sędziwego prof.
Wacława Szybalskiego (fot. dalej),
ilustrowany filmem o jego życiu
The Essence of Life.
4
Spotkanie z prof. Wacławem Szybalskim
(University of Wisconsin-Madison, USA)
Ze strony www RECOMB:
„
Born in 1921 in Lwow, Poland, to a family of intelligentsia (his father was an
electrical engineer; his mother used crystallography to study the structure of
molecules), Szybalski survived World War II and serial invasions by the Soviet
Union, Germany and then the U.S.S.R. once again. In 1949, after earning a
Ph.D. in chemistry from the Institute of Technology in Gdansk, he moved to
Copenhagen. In 1950, recommendations from eminent Danish scientists,
including the physicist Niels Bohr, helped Szybalski move to a genetics lab at
Cold Spring Harbor on Long Island, N.Y. At Cold Spring Harbor, which was
already a capital of the emerging science of molecular biology, he plunged into
the study of antibiotic resistance. n 1960, after a few years at Rutgers
University, Szybalski joined the McArdle Laboratory at UW-Madison and
started pioneering studies on a virus that infects bacteria. The virus, called
lambda phage, became a mainstay in Szybalski's career-long interest in how
genes are transferred, modified and regulated. At McArdle, he also learned to
alter DNA so cancer cells would be more susceptible to radiation. In 1962,
Szybalski became the first to insert DNA into human cells, and the next year,
the first to create functional DNA in a glass dish. Szybalski invented HAT
selection, a technique for separating those cells that had been genetically
modified.
RECOMB 2015 keynote talk:
The Essence of Life
Just as Stanislaw M. Ulam (1909-1984), I also was born and educated (1921-
1944) as Ch.E. in the multinational, but very Polish and dearly loved by us city
of Lwów (Leopolis, Lvov, Lemberg, and Lviv). Therefore, I will start my Ulam’s
Lecture by sketching his life as the Leopolitan mathematical genius, creator of
the Monte Carlo method and hydrogen bomb, through the years of still lasting
tragedy of our pre-WWII Lwów, as imposed upon us by terror, murders and
finally by practically total deportations of citizenry, as carried by Soviet
Russians, Nazi Germans and their henchmen, secretly assisted by shameless
approval by signatories of the Teheran, Crimea (Yalta) and Potsdam WWII
treaties.Then, I will stress how my exposure to Lwów scientific life (Viva
Profesores Leopoliensis !) has lead to our successes in USA, while contributing
to the physical genetics of DNA as the basis of life, followed by creating new
fields of gene therapy and synthetic biology. Finally, I will introduce the
documentary film, “The Essence of Life”, in which the director, Anna Ferens,
takes her artist’s look at my scientist's life, whereas I will try to add more of the
scientist's perspective”.
Na zdjęciach – prof. Wacław Szybalski
W otoczeniu Zarządu PTBI -1 (W. Rudnicki,
A. Gruca, M. Szachniuk, M. Kotulska)
Fot. P.Górecki
5

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika:

Zgłoś jeśli naruszono regulamin