06.12.2013r.
Ćwiczenie 9: Obliczanie współczynnika pokrewieństwa.
RODOWÓD – usystematyzowany zapis przodków osobnika (probanta).
PROBANT – osobnik poddany ocenie lub taki, którego rodowód jest w danej chwili analizowany.
Rodowód głęboki – obejmuje 5 pokoleń.
Rodowód płytki – obejmuje mniej niż 5 pokoleń.
Rodowód klasyczny (tabelaryczny) – przedstawiony w formie tabeli, zwany również szachownicą rodowodową, gdzie każdy przodek ma ściśle zarezerwowane miejsce; po prawej stronie zestawieni są przodkowie ojca probanta, po lewej jego matki.
Rodowód strzałkowy (strukturalny) – powstaje poprzez przekształcenie rodowodu klasycznego. Ułatwia prześledzenie zależności między określonymi osobnikami dzięki temu, że każdy potomek jest w nim umieszczony tylko raz i w prosty sposób można zauważyć wszystkie drogi – ścieżki łączące interesujące nas osobniki. Ta właściwość odróżnia rodowód strzałkowy od klasycznego i umożliwia ustalenie stopnia spokrewnienia między osobnikami.
Rodowód klamrowy.
Rodowód niepełny – wystąpienie w rodowodzie przodków nieznanych (NN).
Rodowód informuje hodowcę o tym, jaki może być w przyszłości młody probant, a analiza rodowodu ułatwia dobór hodowlany i zapobiega niezamierzonego kojarzeniu w pokrewieństwie.
POKREWIEŃSTWO:
-podobieństwo genetyczne między krewnymi;
-występowanie w genotypach osobników spokrewnionych (krewnych) określonej liczby takich samych genów pochodzących od wspólnego przodka lub kilku wspólnych przodków;
-pokrewieństwo między osobnikami wynika więc z tego, że mają w swoich rodowodach wspólnych przodków;
-stopień tego pokrewieństwa zależy od liczby wspólnych przodków i miejsca, jakie oni zajmują w rodowodach spokrewnionych osobników;
-miarą pokrewieństwa jest wskaźnik pokrewieństwa.
Pokrewieństwo:
-w linii prostej (pradziadek -> dziadek -> ojciec -> dany osobnik -> jego potomstwo);
- w linii bocznej (dany osobnik -> jego bracia, siostry).
Wskaźnik pokrewieństwa:
-mierzy genetyczne podobieństwo między zwierzętami, wynikające z pochodzenia po tym samym przodku lub kilku przodkach wspólnych;
-określa jaki procent identycznych genów posiadają dwa spokrewnione ze sobą osobniki;
-przyjmuje wartość od 0 do 1 lub od 0 do 100%.
WZORY
1.w linii prostej
Rxy=12n
x – przodek, y – potomek
n – liczba pokoleń dzieląca przodka od potomka
½ - udział genów przekazywanych przez przodka jego bezpośredniemu potomkowi
przodekmożewięcejniż−sumowaniepowszystkichścieżkachłączącychprzodkazpotomkiemjednądrogąprzekazywaćswojegenydanemuosobnikowi
2.w linii bocznej
Rxy=12n1+n2
n1 – liczba pokoleń dzielących wspólnego przodka od osobnika x
n2 – liczba pokoleń dzielących wspólnego przodka od osobnika y
½ - udział genów przekazywanych przez przodka jego bezpośredniemu potomkowi−sumowaniepowszystkichścieżkachprowadzącychodwspólnychprzodkówdoosobnikówxiyosobnikxiymogąmiećwięcejniżjednagowspólnegoprzodkalubteżmożewystępowaćkilkakrotnie−różnymidrogami−przekazywaniegenówprzezprzodka
Wskaźnik inbredu:
-miara natężenia hodowli krewniaczej; wsobnej (hodowla w pokrewieństwie prowadzi do wzrostu homozygotyczności i spadku heterozygot, w potomstwie kojarzonych ze sobą zwierząt);
-wyraża stopień homozygotyczności genotypu osobnika, wynikający z genetycznego podobieństwa łączących się gamet w procesie płciowym;
-może przybierać wartości od 0 do 100%;
3.wspólny przodek obojga rodziców sam nie jest zinbedowany
Fx=12n1+n2+1
n1 – liczba pokoleń dzielących wspólnego przodka od matki osobnika
n2 – liczba pokoleń dzielących wspólnego przodka od ojca osobnika
4.wspólny przodek lub przodkowie pochodzą z kojarzeń krewniaczych
Fx=12n1+n2+1×1+Fa
Fa – wskaźnik inbredu wspólnego przodka
Gacololo00